Sposób traktowania braków danych należy ustalić, biorąc pod uwagę znajomość uwarunkowań biznesowych lub wiedzę specjalistyczną z dziedziny będącej przedmiotem analizy. Aby skrócić czas szkolenia i zwiększyć dokładność, celowe może być usunięcie wartości pustych ze zbioru danych. Z drugiej strony obecność wartości pustych może doprowadzić do ujawnienia nowych szans biznesowych lub dodatkowych spostrzeżeń.

Wybierając technikę, należy wziąć pod uwagę następujące cechy danych:

• wielkość zbioru danych;
• liczbę zmiennych zawierających wartości puste;
• ilość brakujących informacji.

Można wskazać zasadniczo dwie strategie postępowania:

• Można wykluczyć zmienne lub rekordy z brakami danych.
• Można podstawić, zastąpić lub wymusić wartości brakujące, stosując w tym celu różne metody.